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ILEE lunch seminar

Presentations Romain Deleu (Geology): Solute transport in underground rivers: study of spatially heterogeneous breakthrough curves by multi-point dye tracing and 3D Computational Fluid Dynamics (CFD) simulations.Justine Bélik (Biology): Can DNA methylation predict the age of a self-fertilizing vertebrate species? 
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Chaire 2024-2025 | Soigner les personnes, le vivant, la terre - La santé en transition pour le bien commun

Au programme Jeudi 10/04/2025 | Soigner la nature La Chaire Notre-Dame de la Paix
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CHITEL 2024 - Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression

Initiated in 1969 by Pullmann and Del Re, the congress is an annual meeting to promote collaboration and friendship between Latin-speaking theoretical chemists. In its early years, European researchers were the main contributors. Subsequently, the Latin American community has made a major contribution, with the emergence of teams whose international reputation now extends far beyond our own community.We are delighted to be holding this meeting at the University of Namur, 55 years after the first CHITEL was organised in Paris, France. We are sure that this 2024 edition will once again be an opportunity to take advantage of the good humour and dynamism of Latin to encourage, develop and strengthen scientific exchanges.We look forward to welcoming you at the University of Namur,The CHITEL 2024 Local Organising Committee. Website
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EMBO Workshop | Establishing state-of-the-art mollusc genomics

EMBO Courses and Workshops are selected for their excellent scientific quality and timelines, provision of good networking activities for all participants and speaker gender diversity (at least 40% of speakers must be from the underrepresented gender). Organisers are encouraged to implement measures to make the meeting environmentally more sustainable.Upon registration - More info and registration on the EMBO website.
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Chill&Sciences | Des virus à l’espace, c’est mathématique !

Le jeudi 30 mai, pour notre dernier Chill&Sciences de la saison, Candy Sonvaux et Alexis Coyette, chercheurs en mathématiques, vous invitent à la découverte des mathématiques où les mouvements des planètes et la propagation des virus s’entremêlent jusqu’à impacter notre société.Chill&Science : des rencontres enrichissantesAvec près de 20 ans d’expérience de cafés scientifiques, le Confluent des Savoirs a mis en place un nouveau concept de rencontres scientifiques. Les Chill&Sciences sont l’occasion unique pour le public de venir échanger et poser des questions aux experts sur des sujets de recherche en lien avec l’actualité et des thématiques citoyennes.Venez profiter de l’ambiance unique et décontractée du Quai22. Des chercheur·es et expert·es des sept facultés de l’Université de Namur présenteront leurs recherches et discuteront avec vous autour d’un verre (ou deux mais jamais sans exagération).En pratiqueLes rencontres s'adressent à toutes et tous dès l'âge de 16 ans. Les soirées sont limitées à une vingtaine de personnes afin de garantir une ambiance décontractée et pour faciliter les discussions. Les rencontres se déroulent si minimum 10 personnes sont inscrites.  Sauf exception, les rencontres se déroulent tous les 2 mois à l'espace culturel de l'Université de Namur, le Quai22, situé au n°22 Rue du Séminaire.Tarif La participation à un Chill&Sciences coûte 5€. Un pass annuel à tarif préférentiel est proposé. Attention : tarif préférentiel pour les étudiants (code de réduction : PromoCDS).Le tarif de réservation comprend une boisson* (soft ou bière), un snack (chips et biscuits) et les frais de gestion liés à l'organisation Sauf annulation de notre part, les réservations sont non remboursables. (* des boissons supplémentaires seront disponibles moyennant paiement électronique.) 
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Soutenance publique de thèse - Valentin GOFFINET

Title of the dissertation: Ion implantation in Low-E coatings Low-emissivity (Low-E) coating technology revolutionizes glass applications for windows, offering high optical transparency while reducing heat transfer. They consist of a silver-based thin film deposed on a glass panel by physical vapor deposition. However, these coatings are fragile and must be placed inside a double-glazing cavity where an inert gas resides. Otherwise, they can be easily degraded by bad atmospheric conditions.The thesis approach is to combine low-E technology with a post-treatment of ion implantation. The research question driving this thesis is: how does ion implantation enhance the durability of low-E coatings containing silver?The experiments conducted during the thesis show that implantation indeed increases the coating resistance while having a small impact on its color. However, the treatment degrades the thermal insulation properties. Hence, a series of hypotheses are formulated based on the literature to explain and control this behavior.A deeper investigation shows that implantation impacts the silver nanostructure. First by dewetting the film which allows reorganization into larger crystallites, second by forcing silver mixing at its interface through ballistic ejections. These two phenomena increase the toughness of the silver interface by interlocking effects. However, dewetting has also been linked to thermal insulation properties degradation. Nonetheless, it was shown that using light gas implantation limits the destructive effect (dewetting) while still inducing good durability (due to interface mixing). Jury Prof. Julien COLAUX (UNamur), présidentProf. Stéphane LUCAS (UNamur), promoteur et secrétaireDr Amory JACQUES (Service Public de Wallonie)Dr Philippe ROQUINY (AGC Glass Europe)Prof. Rony SNYDERS (Université de Mons)
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Soutenance publique de thèse - Virgile NEYMAN

Caractérisation de la tréhalase d’Acyrthosiphon pisum en vue de la conception de nouveaux insecticides RésuméLes pucerons sont des ravageurs majeurs dans l'agriculture, causant des dommages directs aux plantes et agissant comme vecteurs de virus phytopathogènes. Les insecticides conventionnels sont largement utilisés pour les contrôler, mais leur toxicité et leur efficacité posent problème au niveau de l’environnement, sur la santé humaine et avec l’apparition de résistances à ces composés. Ainsi, de nouvelles alternatives sont nécessaires, telles que le contrôle biologique avec l’utilisation de prédateurs ou de parasitoïdes. Cependant, ces méthodes ne sont pas toujours économiquement viables à grande échelle. Dans le cadre de cette thèse, une autre approche est explorée et qui consiste à développer de nouveaux insecticides ciblant les fonctions biochimiques des pucerons.Le projet vise à découvrir de nouveaux inhibiteurs de la tréhalase, une enzyme essentielle pour le métabolisme énergétique des insectes. L'inhibition de cette enzyme pourrait perturber les fonctions vitales des insectes sans affecter les mammifères. Cette recherche s’est déroulée en plusieurs étapes : la purification et la caractérisation complète de la tréhalase d’Acyrthosiphon pisum (le modèle de cette étude), l’analyse in vivo, in vitro et in silico d’inhibiteurs commerciaux sur cette enzyme, avant de passer à la recherche de nouveaux inhibiteurs. Deux points de la lutte intégrée contre les insectes ont été explorés, le contrôle biologique et le contrôle chimique.Le côté biologique a vu l’étude d’une souche de Streptomyces produisant naturellement des métabolites inhibiteurs de la tréhalase, notamment la validamycine A, molécule reconnue dans la littérature comme l’un des meilleurs inhibiteurs, mais non applicable en tant qu’insecticide. D’autres molécules semblent présenter des traits intéressants, mais sans avoir pu réussir à les isoler et les caractériser.Le côté chimique a permis de créer une hypothèse pharmacophore sur base de résultats expérimentaux sur des molécules obtenues par criblage virtuel. Bien que ces molécules ne soient pas utilisables en l’état en tant qu’insecticides, cette hypothèse permet de mieux comprendre les inhibiteurs de tréhalase en général et pourra être utilisée afin d’affiner les analyses futures. JuryProf. Jean-Yves MATROULE (UNamur), présidentDr Catherine MICHAUX (UNamur), promotrice et secrétaireProf. Frédéric FRANCIS (ULiège), co-promoteurProf. André MATAGNE (ULiège)Dr Rudy CAPARROS (ULiège)Dr Morgan HANS (Biocidal)
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Soutenance publique de thèse - Sébastien MEURANT

Sujet de thèse Use of BioID within mitochondria: examples with the study of human mitochondrial co-translational import process and with the identification of MPV17 function Résumé This thesis was divided in two different parts dedicated to the study of a mitochondrial process and of a mitochondrial protein using a proximity labelling assay called BioID.            The first project was dedicated to the study of a poorly characterized process, the mitochondrial co-translational import. In this process, translation is coupled to the translocation of the mitochondrial proteins, alleviating the energy cost typically associated with the post-translational import relying on chaperone systems. However, the mechanisms are still unclear with only few actors identified but none that have been described in mammals yet. We thus profiled endogenously the TOM20 proxisome using BioID. Despite the enrichment of RNA binding proteins in the TOM20 proxisome, we could not demonstrate a role for a selected candidate, LARP4, in the mitochondrial co-translational import process. Nonetheless, additional uses of this BioID cell line were highlighted such as the monitoring of protein entry inside mitochondria and a potential application in the prediction of mitochondrial protein half-life.The second project was dedicated to the study of MPV17, a protein of the inner mitochondrial membrane whose gene is associated with mitochondrial DNA depletion syndrome. However, the exact molecular function of the protein is still unclear. The approach used in this project was to identify the interacting partners of MPV17, using BioID, to get additional clues about the protein function. In this project we demonstrated an interaction of MPV17 with the MICOS complex but the KO of MPV17 didn’t impact mitochondria ultrastructure. However, the depletion of MPV17 protein led to increased mitochondria-derived vesicles formation. Therefore, we investigated a potential degradation of the mtDNA as the cause of the mtDNA depletion observed in MPV17 KO cells but, despite a higher mitophagy level in KO cells, the blockade of the lysosomal activity didn’t prevent the depletion. Additional in silico analyses suggested a channel activity of MPV17 further supported by its direct interaction with the Cyclophilin D, a protein of the mitochondrial permeability transition pore. Interestingly, MPV17 KO cells also display higher level of mitochondrial calcium which would be related to the degradation of the mtDNA since the blockade of mitochondrial calcium entry prevents the depletion. We thus propose a role of MPV17 as a potential new member of the mitochondrial permeability transition pore whereas in the absence of the protein, the build-up of calcium inside the mitochondria would lead to the observed mtDNA degradation. Jury Prof. Benoît MUYLKENS (UNamur), présidentProf. Patsy RENARD (UNamur), promotrice et secrétaireProf. Thierry ARNOULD (UNamur), co-promoteurProf. Dr. David PLA-MARTIN (Heinrich Heine University Düsseldorf, Germany)Dr Timothy WAI (Institut Pasteur de Paris, France)Prof. Guy LENAERS (Université d’Angers, France)Prof. Sven EYCKERMAN (Universiteit Gent)
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Soutenance publique de thèse - Joëlle GIROUD

Résumé : Impact de la voie UPR sur l’établissement du phénotype sénescent induit par les UVB Le vieillissement cutané, influencé par une combinaison de facteurs intrinsèques et extrinsèques, entraine des dommages capables d'altérer les fonctions cutanées. Parmi les facteurs extrinsèques, les rayonnements ultraviolets (UV) sont responsables du photo-vieillissement de la peau. Ces éléments conduisent notamment à une accumulation de cellules sénescentes capables de contribuer au développement de pathologies liées à l’âge, telles que les cancers cutanés. En effet, la sénescence s’accompagne de profonds changements morphologiques et moléculaires au sein de la cellule. Cela inclut notamment une modification de son sécrétome, qui s'enrichit en cytokines pro-inflammatoires, en facteurs de croissance et en enzymes remodelant la matrice extracellulaire, altérants les caractéristiques des tissus lors du vieillissement. Néanmoins, les mécanismes précis qui aboutissent au phénotype sénescent induit par les UVB restent largement inconnus.            Dans ce contexte, l’objectif principal de ce travail a été d'identifier des mécanismes moléculaires sous-jacents à l’établissement de la sénescence induite par les UVB dans des fibroblastes de derme humains normaux (NHDFs), mécanismes qui pourraient contribuer au vieillissement cutané.  In vitro, nous avons confirmé que des expositions répétées aux UVB induisent la sénescence prématurée des NHDFs et que cet état est associé à l’activation des trois branches de la voie UPR (Unfolded Protein Response) responsables du maintien de l’homéostasie du réticulum endoplasmique (RE), le premier compartiment de sécrétion. Ces observations ont été supportées par une analyse transcriptomique, révélant des éléments de régulation liés aux grandes voies de sénescence et aux fonctions du RE dans les NHDFs exposés aux UVB.    Par la suite, nous avons montré que la branche ATF6α joue un rôle central dans la survenue des biomarqueurs du phénotype sénescent induit par les UVB. En effet, l’invalidation d’ATF6α protège non seulement des changements morphologiques induits par les UVB, mais réduit le pourcentage de cellules positives pour la SA-βgalactosidase (SA-βgal), prévient la persistance des dommages à l'ADN, et modifie l'expression de facteurs majeurs du phénotype sécrétoire associé à la sénescence (SASP).    Le SASP exerçant entre autres une action pro-tumorale, nous avons cherché à évaluer si le milieu conditionné (MC) des fibroblastes exposés aux UVB et invalidé pour ATF6α pouvait impacter le potentiel de migration et d'invasion de cellules issues de mélanomes. Cependant, nous n'avons pas observé d’effets pro-migratoires ou pro-invasifs dépendants d’ATF6α.Afin de mettre en évidence un potentiel rôle d’ATF6α dans un autre processus biologique, nous avons exploité nos analyses transcriptomiques et sécrétomiques et avons identifié un possible effet d’ATF6α sur le contrôle paracrine de l’environnement cutané. Pour explorer cela, nous nous sommes concentrés sur les facteurs du SASP (cytokines et métalloprotéases) régulés par ATF6α et dont l’impact sur l’environnement tissulaire était connu. Ensuite, nous avons traité un modèle d'épiderme humain reconstruit (RHE) avec du MC issu de NHDFs exposés aux UVB ou non, et invalidés ou non pour ATF6α. Etonnement, nous avons observés que le MC des NHDFs exposés aux UVB augmente l’épaisseur du RHE ainsi que la prolifération des kératinocytes basaux, via un mécanisme dépendant d’ATF6α. Enfin, nous avons identifié l'IL8 comme un facteur paracrine majeur impliqué dans ce processus, puisque le blocage d’IL-8 par des anticorps neutralisants prévient la prolifération excessive des kératinocytes.            En conclusion, nous rapportons le rôle d’ATF6α dans la sénescence induite par les UVB ainsi que son impact sur la préservation de l'homéostasie cutanée en condition de stress notamment par la régulation de l’expression des composants du SASP. Cela suggère qu'ATF6α et ses effecteurs pourrait être des cibles prometteuses contrôlant les effets du vieillissement cutané.Abstract: Impact of the UPR pathway on the establishment of the senescent phenotype induced by UVBSkin aging, influenced by a combination of intrinsic and extrinsic factors, can result in damage that has the potential to alter skin functions. Among extrinsic factors, ultraviolet (UV) radiation is responsible for skin photoaging. These factors notably contribute to the accumulation of senescent cells which in turn can contribute to the development of age-related pathologies, including skin cancers. Indeed, senescence is characterized by profound morphological and molecular changes within the cell. This includes a modification of its secretome, which becomes enriched in pro-inflammatory cytokines, growth factors, and matrix-remodeling enzymes, altering tissue characteristics during aging. However, the exact mechanisms driving the senescent phenotype induced by UVB remain largely unknown.          In this context, the main objective of this work was to identify the underlying molecular mechanisms responsible for the establishment of UVB-induced senescence in normal human dermal fibroblasts (NHDFs), mechanisms that may play a role in skin aging.   In vitro, we confirmed that repeated exposures to UVB induce premature senescence of NHDFs and that this state is associated with the activation of the three branches of the Unfolded Protein Response (UPR), which are responsible for maintaining endoplasmic reticulum (ER) homeostasis, the primary cellular secretion compartment. These observations were supported by transcriptomic analysis, revealing regulatory elements related to major senescence pathways and ER functions in UVB-exposed NHDFs. Subsequently, we demonstrated that the ATF6α branch plays a central role in the development of the UVB-induced senescent phenotype. Indeed, the silencing of ATF6α not only protects against morphological changes induced by UVB, but also reduces the percentage of senescence-associated β-galactosidase (SA-βgal) positive cells, prevents the persistence of DNA damage, and alters the expression of major factors associated with the senescence-associated secretory phenotype (SASP).The SASP, exerting a pro-tumoral action, led us to assess whether the conditioned medium (CM) from UVB-exposed fibroblasts invalidated for ATF6α could impact the migration and invasion potential of melanoma cells. However, we did not observe any ATF6α-dependent pro-migratory or pro-invasive effects.  To highlight a potential role of ATF6α in another biological process, we further analyzed our transcriptomic and secretomic analyses and identified a possible effect of ATF6α on the paracrine control of the skin environment. To explore this, we focused on SASP factors (cytokines and metalloproteinases) regulated by ATF6α and whose impact on tissue environment was known. Subsequently, we treated a reconstructed human epidermis (RHE) model with CM from NHDFs exposed or not to UVB and invalidated or not for ATF6α. Surprisingly, we observed that the CM from UVB-exposed NHDFs increased the thickness of the RHE as well as the proliferation of basal keratinocytes, via an ATF6α-dependent mechanism. Finally, we identified IL8 as a major paracrine factor involved in this process, as blocking IL-8 with neutralizing antibodies prevented excessive proliferation of keratinocytes.  In conclusion, we report the role of ATF6α in UVB-induced senescence and its impact on the preservation of skin homeostasis under stress conditions, particularly through the regulation of the expression of SASP components. This suggests that ATF6α and its effectors could be promising targets for controlling the effects of skin aging. Jury Prof. Yves POUMAY (Département de Médecine, UNamur), présidentProf. Florence CHAINIAUX (Département de Biologie, UNamur), promotrice et secrétaireProf. Olivier PLUQUET (Canther, Université de Lille), co-promoteurProf. Isabelle PETROPULOS (Adaptation Biologique et Vieillissement, Sorbonne Université)Prof. Jérôme LAMARTINE (Laboratoire de Biologie Tissulaire et d’Ingénierie thérapeutique, Université Claude Bernard Lyon 1)Prof. Fabienne FOUFELLE (Maladies métaboliques, diabète et comorbidités, Sorbonne Université)
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Soutenance publique de thèse - Mahaut BEGHIN

Thèse de doctorat en sciences biologiques Résumé Nanotechnology is one of the most important fields of innovation in the 21st century. Engineered nanoparticles are used in a wide range of products and industries such as cosmetics, electronics, food packaging, textiles, and even medicine. However, the rapid development of these new materials comes with the challenge of accurately assessing the risks they may pose to human health and the environment. Once released into aquatic ecosystems, nanoparticles are expected to interact with other co-occurring pollutants, including other nanoparticles. However, the effects resulting from exposure to mixtures of nanomaterials on aquatic organisms are rarely known.In this context, the present thesis aimed to assess the effects of exposure to two of the most widely used nanoparticles, zinc oxide (ZnO) and titanium dioxide (TiO2), separately and in a mixture, using a model fish species, the rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Different approaches were developed to achieve this goal. First, an in vitro model was used to highlight the differences in behavior and toxicity between the individual nanoparticles and their mixture. Rainbow trout were then exposed to environmentally realistic concentrations of the two nanoparticles individually and their mixture. In the first place, the gill's innate immunity and its associated microbiota were studied as they represent the first line of defense of the organism's immune systems, but also because gills represent one of the routes of entrance for nanoparticles in the organism. A stress-on-stress approach was also employed. The trout were challenged with a pathogenic bacterium following the exposure to the nanomaterials to assess their effect on the immunocompetence of the fish.Through this multifaceted approach, this thesis helped provide new insights into the behavior of nanoparticle mixtures and their potential for toxicity. Our findings show that exposure to nanoparticles, usually regarded as having low toxicity potential such as TiO2, may induce toxicological effects when interacting with other nanoparticles. Jury Prof. Frédéric SILVESTRE (UNamur), présidentProf. Patrick KESTEMONT (UNamur), promoteur et secrétaireDr Valérie CORNET (UNamur)Prof. Joachim STURVE (University of Gothenburg)Prof. Catherine MOUNEYRAC (Université Catholique de l’Ouest)Prof. Mutien-Marie GARIGLIANI (Université de Liège)
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Journée d’études et d’échanges IRDENA - Etudiants Engagés, Connaissances Vives : Le Nouveau Paradigme Éducatif

La matinée sera marquée par une conférence de Julien Berthaud, spécialiste de l’intégration sociale des étudiants, qui partagera ses apports sur comment cette intégration devient un véritable vecteur de réussite.Ensuite, les communications scientifiques et les partages d’expériences enrichiront nos connaissances et susciteront des débats constructifs. Le déjeuner sera l’occasion de découvrir les projets innovants des étudiants, mis en lumière dans une exposition inspirante.L’après-midi promet d’être tout aussi stimulante avec une table ronde modérée par Sabine Henry, où experts échangeront sur le service learning, l’entrepreneuriat éducatif et la spiritualité. Ce dialogue dynamique sera suivi d’une activité de clôture: la fresque de l’engagement, un brainstorming collectif qui posera les bases d’un jeu éducatif innovant.Rejoignez-nous pour cette journée d’échanges et de réflexion, et contribuez à façonner le futur de l’éducation où l’engagement des étudiants et la vivacité des connaissances seront les pierres angulaires d’un nouveau paradigme éducatif.
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Soutenance publique de thèse de doctorat en Sciences chimiques - Amélie MAERTENS

Jury Prof. Benoît CHAMPAGNE (UNamur), présidentProf. Carmela APRILE (UNamur), secrétaireProf. Eric GAIGNEAUX (UCLouvain)Prof. Sonia FIORILLI (Politecnico di Torino)Prof. Wouter MARCHAL (UHasselt) Abstract Heterogeneous acid catalysts became over the years essential to our modern industrial world. Among the possible forms of solid materials with acidic properties, porous silica-based structures embedding active single-sites showed highly promising catalytic activity for various reactions. The insertion of heteroelements inside the SiO2 network is known to introduce a combination of Brønsted and Lewis acid sites which depends on the nature of the element and influences the catalytic properties of the solid. The present thesis investigates the link between the Brønsted/Lewis acid balance introduced by different elements (Al, Ga, In, Ti, Zr, Hf) inserted or finely dispersed in/onto the structure of extra-small silica nanospheres and the catalytic performances of the solids for two distinct biomass derivatives valorization reactions (i.e. conversion of glycerol to solketal and of ethyl levulinate to γ-valerolactone).The optimizations of the syntheses were particularly focusing on the insertion of the element inside the SiO2 matrix to maximize the number of acid sites. In-depth characterizations were conducted on the different substituted nanospheres to probe their morphological, structural, and textural features. A special attention was dedicated to the characterization of the surface acidity. These results were put into perspective with the catalytic performances of the materials. At the end of the investigations, we were able to explain the difference in terms of catalytic activity between the different studied solids and identify the optimal acid properties for the targeted reactions. The stability and recyclability of the best working solids were also assessed, an acute tuning of reaction conditions enabled to reach significatively high conversions, and their performances were tested in challenging conditions (i.e. close to crude feedstock).The knowledge unveiled through these investigations will give precious insight to design new silica-based catalysts with the appropriate acidity for a wide variety of acid-catalyzed reactions.
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