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Soutenance publique de thèse de doctorat en sciences physiques - Tanguy COLLEU

JuryProf. Francesca CECCHET (UNamur), présidenteProf. Luc HENRARD (UNamur), promoteur et secrétaireProf. Gian-Marco RIGNANESE (UCLouvain), co-promoteur Prof. Vincent LIEGEOIS (UNamur)Prof. Xavier GONZE (UCLouvain) Prof. Humbert BERNARD (Université de Nantes)AbstractSensing technologies are critical across scientific, industrial, and medical domains, enabling the detection and analysis of various (bio)chemicals. Vibrational spectroscopies, such as Raman spectroscopy and infrared absorption spectroscopy, offer powerful and non-destructive means to characterize these molecular structures and their interactions. However, their application is often limited by inherently small cross-sections, curbing the analysis of low concentration. Surface-enhanced vibrational spectroscopies (SEVS), including surface-enhanced Raman scattering (SERS) and surface-enhanced infrared absorption (SEIRA), address these limitations by using electromagnetic field enhancements associated with localized surface plasmon resonances (LSPR) in nanostructured metal substrates. The resonant coupling between plasmons and molecular vibrations significantly enhances spectroscopic signals, facilitating trace molecule detection and real-time chemical reaction monitoring.Despite experimental success, the theoretical understanding of SEVS remains incomplete, presenting a challenge in simulating plasmonic responses and molecular vibrational modes within a unified framework. This thesis aims to bridge this gap using a combination of Discrete Dipole Approximation (DDA) and Self-Consistent Field Hartree-Fock (SCF-HF) methods, focusing on SEIRA to complement existing SERS studies.Our work begins with isolated gold particles analysed via DDA, benchmarked against Mie theory. We then explore coupled disk systems, revealing hot spots and polarization-dependent extinction cross-sections. The study of nanorods with infrared plasmonic resonances demonstrates that the observed SEIRA effect is driven by the strong coupling between plasmon excitations and molecular vibrations, rather than by the local field response of molecules. This insight shifts the focus towards designing plasmonic systems sensitive to environmental changes rather than merely enhancing the local field.RésuméLes technologies de détection sont cruciales dans les domaines scientifique, industriel et médical, permettant la détection et l'analyse de divers produits chimiques. Les spectroscopies vibrationnelles, telles que la spectroscopie Raman et l'absorption infrarouge, offrent des moyens puissants de caractériser les structures et les interactions moléculaires. Cependant, leur application est souvent limitée par des sections efficaces intrinsèquement petites, en particulier pour les molécules à faible concentration ou dans des environnements complexes. Les spectroscopies vibrationnelles exaltées en surface (SEVS), incluant la spectroscopie Raman exaltée en surface (SERS) et l'absorption infrarouge exaltée en surface (SEIRA), répondent à ces limitations en utilisant les renforcements du champ électromagnétique associés aux résonances plasmoniques de surface localisées (LSPR) dans les substrats métalliques nanostructurés. Le couplage résonant entre les plasmons et les vibrations moléculaires améliore considérablement les signaux spectroscopiques, facilitant la détection de molécules à l'état de trace et la surveillance en temps réel des réactions chimiques.Malgré leur nombreuse preuve expérimentale, la compréhension théorique des SEVS reste incomplète, posant un défi pour la simulation des réponses plasmoniques et des modes vibratoires moléculaires dans un cadre unifié. Cette thèse vise à combler cette lacune en utilisant une combinaison de l'Approximation des Dipôles Discrets (DDA) et de la méthode deHartree-Fock (SCF-HF), en se concentrant sur le SEIRA pour compléter les études existantes sur le SERS.Notre travail commence par l'analyse de particules d'or isolées via DDA, comparées à la théorie de Mie. Nous explorons ensuite des systèmes de disques couplés, révélant des hot spots et des sections efficaces d'extinction dépendant de la polarisation. L'étude de nanorods avec des résonances plasmoniques infrarouges démontre que l'effet SEIRA observé est dû à un fort couplage entre les excitations plasmoniques et les vibrations moléculaires, plutôt qu'à la réponse au champ local des molécules. Cette découverte suggère d’orienter la conception de systèmes plasmoniques vers une sensibilité aux changements environnementaux plutôt que vers le simple renforcement du champ local. 
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Soutenance publique de thèse de doctorat en sciences physiques - Emerick GUILLAUME

JuryProf. Yoann OLIVIER (UNamur), PresidentProf. Luc HENRARD (UNamur), SecretaryProf. Ken HAENEN (UHasselt)Prof. Danny VANPOUCKE (UHasselt)Prof. Paulius POBEDINSKAS (UHasselt)Prof. Rozita ROUZBAHANI (UHasselt)Prof. Audrey VALENTIN (Université Sorbonne Paris-Nord)Prof. Anke KRÜGER (Universität Stuttgart)Dr Michael SLUYDTS (ePotentia)RésuméRadical attack and recombination are thought to play an important role in the atomic-scale mechanisms driving the growth of diamond. Unfortunately, accurate ab-initio calculations of the growth mechanisms are scarce. This work presents an analysis of growth-related reactions, including the ones involving hydrogen and methyl radicals, on (100), (111) and (113) H-passivated diamond surface. The reactions investigated here include the migrations of different species. The reactions between the intermediate growth steps of the nucleation (including some etching mechanisms) are characterised through their reaction rate coefficients.The (climbing) nudged elastic band method is used to identify the minimum energy path of the reactions, which reveals either a tight or a loose transition state depending on the presence or absence of an energy barrier.  Following the determination of the energy profile a given reaction, the vibrational spectra of its reactants, products and transition state is computed to derive its reaction rate coefficient by means of (variational) transition state theory calculations. These temperature- and pressure-dependent reaction rate coefficient have great potential: using multi-scale methods (e.g. kinetic Monte-Carlo), they provide insights into the best conditions to grow single crystal diamond. Temperature, pressure and radical densities in the reactor influence both the rate and quality of the growth, and the versatility of the results presented herein allows to account for these factors. The approach used in this work can be generalised to any crystallographic orientation of diamond, and even to other semiconductor surfaces.
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Soutenance publique de thèse de doctorat en sciences biologiques - Alexis CHASSEUR

JuryProf. Thierry ARNOULD (UNamur), présidentProf. Benoît MUYLKENS (UNamur), secrétaireProf. Sébastien PFEFFER (Université de Strasbourg)Prof. René REZSOHAZY (UCLouvain)Prof. Catherine SADZOT (ULiège)Prof. Dr Benedikt KAUFER (Freie Universität Berlin)Prof. Carine VAN LINT (ULB)Dr Damien COUPEAU (UNamur),RésuméLes ARN existent sous diverses formes dans la cellule : les ARN messagers (ARNm), les ARN de transfert (ARNt) et ribosomaux (ARNr) et les petits ARN régulateurs (ARNsn, miARN, snoARN). Les ARN circulaires (ARNcirc) jouent également un rôle clé en servant de matrice pour la traduction, en inhibant des ARN régulateurs par interaction de séquence, ou en recrutant des protéines pour moduler leur activité.L’herpèsvirus des gallinacés, plus connu sous le nom de virus de la maladie de Marek (MDV), provoque un lymphome agressif chez le poulet, entrainant sa mort dans un délai de quelques semaines. Ceci est dû aux nombreux facteurs de virulence qu’il produit. Notamment, MDV produit un facteur de transcription, Meq, qui induit la transformation des cellules dans lesquelles le gène est exprimé. Ce projet de thèse s’intéresse à un ARNcirc dérivé de ce gène.Cette étude a d'abord identifié de nombreux ARNcirc encodés par MDV, notamment lors de la lymphomagenèse, à partir de quatre principaux locus viraux : l'OriLyt, vTR, LAT et Meq. Le développement du programme vCircTrappist a montré que des virus apparentés encodent également des ARNcirc similaires, reliant la circularisation des transcrits viraux à un mécanisme inconnu.Focalisée sur circMeq, l'étude a révélé que cet ARNcirc atténue la virulence de MDV, en contraste avec le rôle précédemment attribué à Meq. Cette conclusion repose sur l'inhibition sélective de circMeq ou de linMeq via des mutations dans le génome viral.Cette thèse a révélé des propriétés insoupçonnées du gène Meq, ouvrant la voie à des recherches futures, notamment des expériences in vivo pour explorer le rôle de circMeq dans la transmission de MDV. 
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50 ans de microscopie électronique à l’UNamur

Au programme 16h00 | Accueil des participants dans le hall de la Faculté de médecine16h30 | Séance anniversaire et inaugurale17h30 | Drink et visite (en groupe) des laboratoiresParticipation externe sur invitation. Une question ?  Contacter Jean-François Colomer : jean-francois.colomer@unamur.be 
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1st Global Chinese Materials Conference (GCMC2025)

The conference is co-organized by the University of Namur, Belgium and Wuhan University of Technology, China and supported by Foshan Xianhu Laboratory and other organisms.More info on the GCMC2025 website...
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PiDay 2025 : Une matinée pour découvrir le monde fascinant des mathématiques ! (Complet)

Quand : Mercredi 12 mars 2025 de 9h à 12hCombien : GratuitLangue : FrançaisPublic : 5-6ème secondaireLieu de RDV : Confluent des Savoirs · UNamur – Rue Godefroid 5, 5000 Namur.Au programme, des mini-conférences et des ateliers :8h30-9h00 : Accueil des groupes9h00-9h40 : Alexandre Mauroy (UNamur) · Un monde sans maths : c’est le PI-ed ou ça fait PI-tié ?A ton avis, comment serait un monde sans les maths ? Ce serait sans doute un peu moins amusant si tu fais des maths comme on joue au sudoku. Ou ce serait beaucoup plus fun si, au contraire, tu ne les aimes pas trop… Mais en fait, est-ce que les maths se résument à un jeu intellectuel pour certains et une torture de l’esprit pour tous les autres ? Sont-elles vraiment utiles dans la vie réelle ? Nous tenterons de répondre à ces questions et découvrirons ensemble comment les maths se retrouvent dans notre quotidien. Alors, un monde sans maths, c’est le pied ou ça fait pitié ? A toi de décider !9h40-10h20 : Timoteo Carletti (UNamur) · 𝜋, Connectivité et Réseaux : Un Cercle Sans FinOn parle de réseaux sociaux, comme Facebook ou TikTok, mais aussi de réseaux de transports, par exemple train, avion, voitures, … Pourquoi utiliser le même mot ? A ton avis, qu’est-ce qu’ils ont en commun ces “réseaux” ? Ensemble nous allons découvrir l’objet mathématique réseau, ses propriétés et son utilisation bien au-delà des cas ci-cités. On verra qu’on peut utiliser un réseau pour analyser une BD ou un roman, ou encore proposer une nouvelle façon d’écrire la musique.10h20–10h40 : Pause10h40-11h40 : Trois ateliers en parallèle - chacun de 20 minutes.1) Des maths pour dessinerEst-il possible de reproduire n’importe quelle image en un trait continu, sans lever le stylo ? Dans cet atelier, nous utiliserons les maths pour y parvenir avec l’aide d’une imprimante 2-axes.2) Des maths pour contrôler des robotsNous allons découvrir ensemble comment agir, grâce aux mathématiques, sur des systèmes complexes tels que des robots (roulants ou volants) afin qu’automatiquement, ils réalisent une tâche donnée.3) Des maths pour étudier des robots sociauxNous allons montrer comment les maths permettent d’étudier le comportement d’un groupe de robots sociaux qui peuvent communiquer entre eux et réaliser une tâche fixée. Cette activité est organisée avec le soutien de la Wallonie Recherche Découvrez la programmation en Wallonie et à Bruxelles
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L’eau, un bien commun à préserver

A quelques jours de la Journée mondiale de l’eau et du Printemps des Sciences 2025, nous vous invitons à une conférence inaugurale sur la thématique de l’eau comme bien commun. Dans une société marquée par les crises et les dérèglements climatiques, réaffirmer la place de l’eau comme “bien commun” pourrait être une voie prometteuse pour mieux préserver ce patrimoine collectif si précieux.4 expert·e·s aux profils variés viendront partager leurs perspectives pour éclairer cet enjeu crucial.Au programme :Mots d’introduction et de bienvenue : Adrien Dolimont, Ministre-Président de la Wallonie et Ministre en charge de la Recherche Annick Castiaux, Rectrice de l’Université de NamurNicolas Velings, Directeur du Département des Sciences, des Technologies et du Vivant de la Haute Ecole Louvain en Hainaut et Président de Synhera  Table-ronde animée par Anne-Sophie Bruyndonckx, avec :Nicolas Brasero, Coordinateur du Contrat de Rivière Haine ASBLAurore Degré, Professeure de physique des sols et d’hydrologie et Vice-Doyenne à l’Enseignement à l'ULiège – Gembloux Agro-Bio TechPatrick Kestemont, Professeur ordinaire de la Faculté des Sciences de l'UNamur, Directeur du laboratoire de Physiologie et Toxicologie Environnementale, Institut de Recherche Life, Earth & EnvironmentLaura Rizzerio, Philosophe, Professeure à l'UNamur, Directrice du Centre Universitaire Notre-Dame de la Paix et membre de l'Institut ESPHINEchanges avec le publicLe Printemps des Sciences est LE rendez-vous incontournable de la culture scientifique et technologique (STEM) en Wallonie et à Bruxelles. L’édition 2025, qui se déroulera du 24 au 30 mars 2025, a pour thème “Eau-rêka”.
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Soutenance publique de thèse en sciences biologiques - Martin Vastrade

La défense aura lieu dans l'auditoire M21 (bâtiment 6), accessible via la Cour des Cercles au 3, rue Joseph Grafé.  Elle sera suivie d'un drink, qui prendra place dans l'Espace Bauchau (bâtiment 22), également accessible via la Cour des Cercles au 3, rue Joseph Grafé."Evolution and consequences of androgenesis in the invasive clam genus Corbicula".Chez la plupart des Eucaryotes, la reproduction sexuée implique la production de gamètes réduits par méiose canonique, suivie d’une fécondation pour restaurer la ploïdie parentale et produire une progéniture génétiquement variable. Cependant, différents modes de reproduction ont émergé indépendamment et à plusieurs reprises chez les Eucaryotes, montrant de diverses modifications des mécanismes de la gamétogenèse pour produire une descendance qui restaure ou maintient la ploïdie parentale sans méiose canonique. Parmi eux, plusieurs modes de reproduction asexuée impliquent encore la méiose et la fécondation, mais seul le génome paternel ou maternel est transmis à la génération suivante. L'un de ces modes de reproduction est l'androgenèse, dans lequel la progéniture hérite uniquement de l'entièreté du génome nucléaire paternel, tandis que les chromosomes nucléaires maternels sont perdus par divers processus. Ce mode de reproduction permet une transmission clonale du génome paternel à la descendance, tandis que le génome nucléaire maternel n'est pas transmis. Dans la plupart des cas, le génome mitochondrial de l'ovocyte est néanmoins transmis. L'androgenèse est considérée comme du parasitisme sexuel où les ovules des femelles sont des ressources utilisées par les mâles pour propager leurs gènes. Ce parasitisme sexuel peut même se produire entre espèces distinctes.Bien que l'androgenèse soit un mode de reproduction rare dans la nature, il est répandu chez les palourdes du genre Corbicula. Ce groupe de bivalves présente des caractéristiques reproductrices complexes : le mode de reproduction peut être sexué, impliquant des spermatozoïdes uniflagellés, ou androgénétique, avec la production de spermatozoïdes biflagellés non réduits ; le niveau de ploïdie varie de la diploïdie, triploïdie, ou tétraploïdie ; le système sexuel inclut le gonochorisme strict, l'hermaphrodisme simultané, l'androdioécie, la trioécie, voire l'hermaphrodisme séquentiel et la gynodioécie ; enfin, leurs stratégies d'incubation des larves incluent l'oviparité, l'ovoviviparité ou la viviparité. Étonnamment, alors que les lignées androgénétiques de Corbicula sont abondantes en Asie, en Afrique et en Océanie, et envahissantes en Amérique et en Europe, les espèces sexuées restent restreintes à quelques localités dans leur aire de répartition native.En raison des traits de vie inhabituels des palourdes Corbicula, leur taxonomie est non résolue et la définition des espèces est complexe dans ce groupe. Les lignées androgénétiques peuvent utiliser les ovocytes d'autres espèces pour se reproduire, entraînant un « mismatch cytonucléaire » : le génome nucléaire d'une espèce est combiné avec le génome mitochondrial d'une autre espèce dans la progéniture. Dans certains cas, le génome maternel est partiellement transmis, conduisant à la formation de zygotes polyploïdes avec les génomes nucléaires paternel et maternel. Lorsque cela se produit entre différentes espèces de Corbicula, ce phénomène conduit à la formation d'hybrides, brouillant ainsi la délimitation des espèces dans ce taxon.Le genre Corbicula est un modèle unique pour étudier l'évolution des caractéristiques reproductrices chez les animaux. Le présent travail aborde des questions sur l'évolution de l'androgénèse, la sexualité occasionnelle, la délimitation des espèces, les hybridations et l'invasion biologique.Membres du juryPr. Karine Van Doninck (Promotrice, Université Libre de Bruxelles)Dr. Jonathan Marescaux (Co-promoteur, e-biom)Pr. Thierry Backejau (Royal Belgian Institute of Natural Sciences)Pr. Alice Dennis (Université de Namur)Pr. Jean-François Flot (Université Libre de Bruxelles)
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