A l’issue de ce cours, l’étudiant doit :
Savoir comment les bactéries/archées/eucaryotes unicellulaires sont structurées
Comprendre comment ces microorganismes génèrent leur énergie
Comprendre comment ces microorganismes peuvent causer des maladies
Comprendre comment on isole et identifie ces microorganismes
Comprendre comment on peut tuer ces microorganismes à l’extérieur et à l’intérieur d’un hôte
Comprendre les mécanismes d’évolution génétique
Comprendre les mécanismes de résistance aux antibiotiques
Comprendre l’intérêt du microbiote dans la bonne santé de l’hôte
Savoir comment les virus sont structurés
Comprendre comment les virus entrent dans la cellule
Comprendre comment les virus se répliquent dans la cellule
Comprendre ce que peut faire la cellule pour limiter la réplication virale
Comprendre comment les virus sortent de la cellule?
Comprendre comment les virus évoluent
Comprendre comment cultiver les virus
Comprendre comment identifie-t-on les individus infectés par un virus
Comprendre comment peut-on empêcher la réplication virale in vivo
Ce cours a pour objectif de faire découvrir la vie à l’échelle ‘micro’. Cette découverte se fera en plusieurs étapes.
1. Comprendre les bases de la microbiologie.
Après un bref historique de la microbiologie et de ses découvertes marquantes, nous commencerons par détailler et comparer les structures des bactéries, des archées, des eucaryotes microbiens et des virus.
2. Découvrir la diversité microbienne.
Comprendre la classification des microorganismes et leur taxonomie.
3. Étudier la réplication des microorganismes.
Appréhender les techniques de culture et d’identification en laboratoire.
4. Explorer l'interaction entre microorganismes et hôtes
Comprendre les relations symbiotiques (commensalisme, mutualisme, parasitisme) entre les microorganismes et leurs hôtes.
5. Découvrir les mécanismes de virulence et l’évasion immunitaire.
Étudier les mécanismes de défense des microorganismes. Comprendre les bases de l'immunologie en lien avec les agents microbiens (faire le lien avec les réponses immunitaires innée et adaptative vues dans le cours d’immunologie SVETB306).
6. Prévenir et contrôler les infections.
Étudier les principes de base de la désinfection, stérilisation, des antiseptiques, des antibiotiques et des antiviraux. Comprendre les mécanismes de résistance aux antibiotiques et antiviraux.
Nous nous intéresserons aux virus, aux bactéries, aux archées et aux eucaryotes microbiens.
La structure des cellules microbiennes sera décrite en distinguant les 3 domaines que sont les archées, les bactéries et les eucaryotes. Le métabolisme microbien sera exposé en partant de principes fondamentaux de physique et de chimie. L’extraordinaire diversité du catabolisme bactérien sera mise en parallèle avec la multitude d’écosystèmes colonisés par les microbes. L’étude de l’anabolisme illustrera l’universalité des voies de biosynthèse des macromolécules. La description de la génétique microbienne et notamment des mécanismes de variations constituera la base moléculaire des phénomènes de résistance aux agents antimicrobiens. Les méthodes de prophylaxies et de chimiothérapie antibiotique seront exposées.
La seconde partie du cours décrira le cycle viral, de l’entrée du virus dans l’organisme hôte à l’infection d’un nouvel individu en passant par le détournement de la machinerie cellulaire et la subversion de la réponse immune. Les différents taxons seront détaillés notamment durant l’exposition des mécanismes de réplication du génome viral. Finalement, différentes stratégies antivirales seront exposées.
Les bactéries
Les archées
Les eucaryotes unicellulaires
Le métabolisme microbien
Culture et identification microbienne
Contrôle des microorganismes dans l’environnement
Chimiothérapie antimicrobienne
Génétique bactérienne et résistance aux antibiotiques
Microbiote et facteurs de virulence
Introduction à la virologie
Culture et identification des virus
Génome et génétique virale
Structure de la capside et de l’enveloppe
Attachement et entrée du virus
Synthèse de l’ARN viral à partir d’un modèle ARN
Transcription et maturation de l’ARN viral
Réplication du génome des virus à ADN
Transcriptase inverse et intégrase
Traduction
Assemblage, sortie et maturation du virion
Évolution des virus
Antiviraux
Cours ex cathedra avec projections de powerpoints.
Capsules vidéo reprenant certaines notions clés.
Travaux pratiques obligatoires.
Examen écrit portant sur la matière vue aux cours théoriques et dispensée pendant les travaux pratiques.
Principles of Virology, 4th edition, Flint, Racaniello, Rall and Skalka, ASM press, ISBN 978-1-55581-9514
ViralZone, http://viralzone.expasy.org/
Prescott’s microbiology, 10th edition, Willey Sherwood and Woolverton, Mc Graw Hill education, ISBN 978-1-259-28159-4
Veterinary Microbiology and Microbial Disease, 2nd edition, Quinn, Wiley-Blackwell, ISBN-13: 978-1405158237
| Formation | Programme d’études | Bloc | Crédits | Obligatoire |
|---|---|---|---|---|
| Bachelier en médecine vétérinaire | Standard | 0 | 4 | |
| Bachelier en médecine vétérinaire | Standard | 3 | 4 |