Dans de nombreux exemples de mécanismes moléculaires, la structure tridmensionnelle des protéines permet d'expliquer des processus essentiels tels que la liaison de partenaires, la catalyse ou l'allostérie. Au terme du cours, l'étudiant(e) doit être capable d'analyser une structure tridimensionnelle de protéines, d'avoir une attitude critique quant à la validité de la structure proposée, et être familiarisé avec les techniques de détermination et de prédiction de la structure tridimensionnelle des protéines.
Familiariser l'étudiant avec la structure tridimensionnelle (3D) des protéines, la détermination expérimentale de cette structure 3D ainsi que les méthodes de prédiction de la structure 3D. La manipulation des protéines (ingénierie des protéines) sera aussi abordée, à l'aide d'exemples issus de la littérature et d'orateurs externes.
Approches expérimentales et théoriques liées à la modélisation de la structure 3D des protéines. Limites et possibilités de manipulation des protéines.
- Rappels (structure 3D des protéines)
- Détermination de la structure 3D d'une protéine (DRX, RMN) : concepts, applications et exemples
- Prédiction de structure 3D
- Les changements de conformation
- Prédiction de la fonction des protéines
- Structure 3D des protéines membranaires
- Ingénierie des protéines
Un TP sur la cristallisation d'une protéine et l'analyse initiale d'une diffraction de rayons X est proposée
Le cours est donné avec des présentations powerpoint qui sont disponibles en format PDF sur le site Webcampus. Des conférenciers invités sont conviés à présenter leurs recherches relatives à la structure 3D et à la fonction des protéines ou des complexes de protéines.
Le mode d'évaluation sera communiqué lors du premier cours. Habituellement, elle est constituée de deux parties :
- un résumé des chaque conférence invitée, possiblement accompagné de l'analyse d'un article publié par un des orateurs
- une présentation d'article du domaine, et la participation active à la présentation d'articles par les autres étudiant(e)s