Familiariser l'étudiant avec la structure tridimensionnelle (3D) des protéines, la détermination expérimentale de cette structure 3D ainsi que les méthodes de prédiction de la structure 3D. La manipulation des protéines (ingénierie des protéines) sera aussi abordée, à l'aide d'exemples issus de la littérature et/ou de l'intervention d'orateurs externes.
A l'issue du cours, les étudiants maitriseront les concepts liés à la structure d'une macromolécule biologique, seront capables de comprendre de façon critique un article scientifique, sauront synthétiser et présenter des résultats.
Le cours sera constitué de :
- une partie relative aux techniques expérimentales de détermination de la structure de macromolécules biologiques,
- une partie relative aux approches théoriques de modélisation de macromolécules biologiques.
Outre un ensemble de concepts théoriques, une mise en pratique sera proposée sous forme de tutoriel(s). Un rapport sera remis à une date fixée par les enseignants et servira de base pour l'examen.
- Description succincte des thèmes abordés
Interactions physiques au sein des protéines et contributions énergétiques qui permettent le repliement et la stabilité de la structure repliée des macromolécules biologiques. Des notions telles que les « champs de force » seront également abordées.
Techniques expérimentales de détermination de la structure de macromolécules biologiques. Des méthodes physicochimiques permettent de proposer un modèle de la structure tridimensionnelle d'une protéine. Ces méthodes sont notamment la diffraction de rayons X sur cristaux de protéines et la résonance magnétique nucléaire. D'autres approches, telles que la fluorescence et le dichroïsme circulaire, permettent également de caractériser la structure d'une protéine.
Approches théoriques de modélisation de macromolécules biologiques
Le cours est donné avec des présentations powerpoint qui sont disponibles en format PDF sur le site Webcampus.
Une mise en pratique sera proposée sous forme de tutoriel(s) réalisé dans le pool informatique.
L'évaluation se base sur la réalisation et la défense d'un travail.
voir webcampus
| Formation | Programme d’études | Bloc | Crédits | Obligatoire |
|---|---|---|---|---|
| Master 120 en sciences chimiques, à finalité approfondie | Standard | 0 | 4 | |
| Master 120 en sciences chimiques, à finalité approfondie | Standard | 2 | 4 |