L'exposé succinct de la structure et de la stéréochimie des molécules organiques est suivi de l'étude de la réactivité des principaux groupes fonctionnels. Cette étude s'efforce de mettre en évidence, à travers les mécanismes réactionnels, la logique des transformations des substances organiques. Il est constamment rappelé que ces transformations sont les mêmes (ou similaires) que celles qui se font par catalyse enzymatique dans les cellules vivantes.
Le contenu du cours est défini par les 12 premiers chapitres du livre: "Chimie Organique 1" par H. Hart (Editions Dunod, 2008). Toutefois, certains paragraphes, trop spécialisés et non indispensables à la réalisation des objectifs, sont supprimés (indications précises du professeur).