Acquis d'apprentissage

Compréhension de la façon dont les interactions biologiques (au sein des espèces et entre celles-ci) influencent la manière dont les effets des produits chimiques se transmettent des individus aux populations et aux communautés
 
Comprendre comment ces interactions peuvent entraîner des effets directs et indirects des produits chimiques.
 
Une capacité à utiliser un modèle écologique précodé pour évaluer les effets sur les populations et les communautés.
 
Interprétation des résultats de modélisation et synthèse des effets écotoxicologiques.
 
"Soft skills": travail en groupe, gestion de projet; communication en français et anglais.

 

Objectifs

Apprendre aux étudiants à calculer les effets d’une substance chimique sur les populations et les communautés et à comparer les résultats obtenus au moyen de diverses techniques.

Contenu

Le cours aborde la question des effets des produits chimiques dans un cadre réaliste du point de vue de l’environnement, c’est-à-dire à l’aide de variables au niveau de la population et de la communauté. Les conséquences au niveau de l'écosystème sont également discutées. Après les cours théoriques, les étudiants sont initiés aux modèles en temps continu. Les étudiants sont ensuite invités à utiliser ces outils pour résoudre un ou plusieurs problèmes. Ces outils se basent sur :
·      L’utilisation de RStudio (et Rmarkdown) afin de construire des modèles permettant de réaliser des simulations ;
·      Des approches plus mathématiques pour étudier les systèmes de manière analytique.

Table des matières

Introduction : Prévisions, définitions, motivation du cours
 
Auto-étude du sujet par les étudiants;
 
Session de questions-réponses sur le sujet (dynamique de la population et des communautés);
 
Populations: paramètres, déterminants (chimiques et écologiques) des effets sur les populations. Introduction aux modèles correspondants.
 
Communautés: paramètres, déterminants (chimiques et écologiques) des effets sur les communautés., Introduction aux modèles correspondants.
 
Écosystèmes: conséquences des effets sur les communautés pour les fonctions des écosystèmes.
 
Introduction au problème
 
Séances de questions-réponses et réunions d'avancement.

 

Exercices

Application de modèles écologiques pour quantifier les effets chimiques: niveau de la population et de la communauté. Les étudiants se verront poser un ou plusieurs problèmes sur le vaste sujet des effets des produits chimiques sur les populations / communautés. Ils appliqueront les techniques vues dans le cours théorique pour résoudre ce (ces) problème (s).
 
Sessions d'exercices de calcul: au cours de ces sessions, les étudiants travailleront sur leurs projets

 

Méthodes d'enseignement

Ex-cathedra
 
Séances de questions-réponses et moments de rétroaction. Durant ces moments, les étudiants présentent leurs résultats et les principaux problèmes qui empêchent leur progression. Le personnel enseignant incite les étudiants à rechercher des solutions à ces problèmes.
 
Exercices de calcul en groupe.
 
Lire et discuter de la littérature scientifique

Codage en R

Une combinaison de cours enregistrés et de sessions de questions / réponses en ligne ou réelles

Méthode d'évaluation

Evaluation continue. Evaluation sur base de:
1 / leur participation active au cours (30%);
2 / le rapport final du groupe (55%);
3 / leur degré de professionnalisme (respect des délais, communication polie et ouverte, attitude constructive) (15%)
 
Les "compétences transversales" seront évaluées lors de l'évaluation de ces 3 aspects
En début de cours, les étudiants reçoivent une liste de critères détaillant ces trois aspects. Cette liste reprend, pour l’aspect « participation active », des éléments tels que l’implication de l’étudiant dans le travail et les discussions de groupe, sa participation à la réflexion globale, son aptitude à se poser des questions et à essayer de trouver des solutions. A titre d’exemple, il sera, lors des débats menés durant le cours, demandé à chaque étudiant de s’exprimer au moins une fois sur la question discutée. Le « degré de professionnalisme », quant à lui, reprend des critères comme, par exemple, le respect des délais et des consignes (en séance mais aussi lors de la rédaction du rapport), l’attitude constructive de l’étudiant ou encore sa communication polie et ouverte.

Sources, références et supports éventuels

Plusieurs papier scientifiques .
 
Des slides Powerpoint 
 
Les modèles seront offerts, codés en R.
 
Otto and Day. A Biologist's Guide to Mathematical Modeling in Ecology and Evolution. Princeton, 2007.
 
Tous ces matériaux peuvent être trouvés sur WebCampus

Langue d'instruction