Acquis d'apprentissage

A la fin du cours, l'étudiant doit être capable :
 
- Identifier les capacités métaboliques d'une bactérie donnée à partir de son donneur et de ses accepteurs électroniques.
- Connaître les principales enzymes impliquées dans les voies évoquées
- Connaître les caractéristiques fonctionnelles et structurelles régulant les métabolismes bactériens (ex. carboxysomes, hétérocystes, etc.).
- Connaître des exemples d'interactions symbiotiques métaboliques.
 

Objectifs

Fournir un aperçu de la grande diversité métabolique des bactéries dans le contexte de leur environnement et des méthodes d'étude du métabolisme bactérien et des écosystèmes microbiens.
Être capable d'identifier les voies métaboliques d'un micro-organisme donné (naturel ou hypothétique) à partir des résultats d'expériences.
  Proposer des méthodes pour étudier le métabolisme et les communautés bactériennes.
Concevoir un écosystème simple.
 

Contenu

Types nutritionnels
Phototrophie
Autotrophie
Fixation biologique du diazote
Chimiotrophie
Fermentation
Respiration anaérobie
Acétogénèse
Méthanotrophie
Synthrophie
Méthodes pour étudier le métabolisme bactérien
Méthodes d'étude des communautés microbiennes
Écosystèmes microbiens
 

Méthodes d'enseignement

Le cours est donné sous forme (1) de cours magistraux, (2) lectures d'articles et (3) TPs.

Méthode d'évaluation

L'évaluation sera continue :
examens courts à choix multiples donnés au cours du semestre (20%).
examen oral de fin de semestre (50%)
Evaluation de TPs (discussions et rapports) (30%).
Il n'y a pas d'examen pendant les sessions (juin ou août).
L'examen oral consiste en une discussion sur le métabolisme d'une bactérie (hypothétique) basée sur des voies et/ou énoncés métaboliques et une reconnaissance de structures intracellulaires et/ou d'enzymes participant à des étapes clés des voies métaboliques et/ou proposer des méthodes pour étudier un écosystème donné. et/ou expliquer les bases métaboliques des interactions symbiotiques entre micro-organismes. Les étudiants se verront proposer une sélection de problèmes deux semaines avant l'examen oral. Toutes les évaluations donnent accès au livre/notes mais sans accès Internet.
 

Sources, références et supports éventuels

Brock Biology of Microorganisms

Langue d'instruction

Formation Programme d’études Bloc Crédits Obligatoire
Bachelier en sciences biologiques Standard 0 3
Bachelier en sciences biologiques Standard 3 3