Soutenance publique de thèse de doctorat en Sciences biologiques - Aishwarya Saxena
Abstract
Primarily described as an alarmone, secondary messenger (p)ppGpp, when accumulated, binds to many targets involved in DNA replication, translation, and transcription. In the asymmetrically-dividing a-proteobacterium Caulobacter crescentus, (p)ppGpp has been shown to strongly impact cell cycle progression and differentiation, promoting the non-replicating G1/swarmer phase. Mutations in the major subunits of transcriptional complex, b or b’ subunits, were able to display the (p)ppGpp-related phenotypes even in the absence of the alarmone. We identified that the transcriptional holo-enzyme, RNA polymerase (RNAP) is a primary target of (p)ppGpp in C. crescentus. Furthermore, mutations that inactivate (p)ppGpp binding to RNAP annihilated the (p)ppGpp-related phenotypes and phenocopied a (p)ppGpp0 strain. Our RNAseq analysis further elucidated the changes in the transcriptional landscape of C. crescentus cells displaying different (p)ppGpp levels and expressing RNAP mutants. Since the DNA replication initiation protein DnaA is required to exit the G1 phase, we observed that it was significantly less abundant in cells accumulating (p)ppGpp. We further explored its proteolysis under the influence of (p)ppGpp. Our work suggests that (p)ppGpp regulates cell cycle and differentiation in C. crescentus by reprogramming transcription and triggering proteolytic degradation of key cell cycle regulators by yet unknown mechanisms. In Part II, we identified two σ factors belonging to the ECF family that might be involved in this (p)ppGpp-accompanied phenotypes. In Part III, we propose an overlapping role of the ω subunit, RpoZ, and the heat shock subunit, RpoH, in carbon metabolism.JuryProf. Gipsi LIMA MENDEZ (UNamur), PresidentProf Régis HALLEZ (UNamur), SecretaryDr Emanuele BIONDI (CNRS-Université Paris-Saclay)Prof. Justine COLLIER (University of Lausanne)Dr Marie DELABY (Université de Montréal)
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Soutenance publique de thèse de doctorat en Sciences biologiques - Nathalie Leroux
Abstract
Estrogens originating from human and animal excretion, as well as from anthropogenic sources such as cosmetics, plastics, pesticides, detergents, and pharmaceuticals, are among the most concerning endocrine-disrupting compounds in aquatic environments due to their potent estrogenic activity. While their effects on fish reproduction are well documented, their impact on development, particularly metamorphosis, remains poorly studied. This hormonal transition, mainly controlled by the thyroid axis, is essential for the shift from the larval to the juvenile stage in teleosts.The effects of two contraceptive estrogens on zebrafish (Danio rerio) metamorphosis were evaluated: 17α-ethinylestradiol (EE2), a synthetic reference estrogen, and estetrol (E4), a natural estrogen recently introduced in a new combined oral contraceptive formulation. Continuous exposure from fertilization to the end of metamorphosis allowed the assessment of morphological changes, disruptions of the thyroid axis, and modifications of additional molecular pathways potentially involved in metamorphic regulation.EE2 induced significant delays and disturbances in metamorphosis, affecting both internal and external morphological traits, confirming its role as an endocrine disruptor of concern. In contrast, E4 did not cause any detectable morphological alterations even at concentrations far exceeding those expected in the environment, indicating a limited ecotoxicological risk. Molecular analyses showed that EE2 strongly affected thyroid signaling and energy metabolism during metamorphosis, whereas E4 induced only minor transcriptional and proteomic changes.This study provides the first evidence that EE2 can disrupt zebrafish metamorphosis and highlights the importance of including this developmental stage in ecotoxicological assessments. The results also suggest a larger environmental safety margin for E4, although further research is needed to clarify the mechanisms linking estrogen exposure to metamorphic regulation.JuryProf. Frederik DE LAENDER (UNamur), PrésidentProf. Patrick KESTEMONT (UNamur), SecrétaireDr Sébastien BAEKELANDT (UNamur)Dr Valérie CORNET (UNamur)Prof. Jean-Baptiste FINI (Muséum National d’Histoire Naturelle de Paris)Dr Marc MULLER (ULiège)Prof. Veerle DARRAS (KULeuven)
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Du jeu vidéo à l’intelligence artificielle, escale au Japon
Près de 10 000 kilomètres séparent la Belgique du Japon, un pays qui fascine, notamment pour sa culture riche et pleine de contrastes. Les chercheurs de l’UNamur entretiennent des liens étroits avec plusieurs institutions nipponnes, notamment dans les domaines de l’informatique, des mathématiques ou encore du jeu vidéo. Coup de projecteur sur quelques-unes de ces collaborations.
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Cancer du pancréas : Détecter les premiers signaux invisibles
Souvent détecté trop tard, le cancer du pancréas est l’un des plus agressifs, avec moins de 10 % de survie à cinq ans. À l’Université de Namur, une équipe de chercheurs s’attaque à cette pathologie en étudiant les premiers changements cellulaires liés à la maladie. Objectifs : ouvrir la voie à un dépistage précoce et à de nouvelles pistes thérapeutiques.
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L’intelligence artificielle au service de l’imaginaire éducatif : le pari innovant d’André Fűzfa et Fabrice Rasir
Expert en astrophysique, le Professeur André Fűzfa (Faculté des sciences, Institut Naxys) exploite aussi ses connaissances scientifiques pour faire voyager chacune et chacun dans le monde de l’imaginaire, grâce à la littérature. Retrouver Ganymède est son nouveau roman, cocréé avec l’illustrateur Fabrice Rasir, alumni du Département de mathématique. Un livre qui intègre des images générées par l’intelligence artificielle (IA). Le roman est donc un savant mélange d’IA graphique, de physique et de fiction qui permet de stimuler l’imaginaire tout en apportant une dimension instructive.
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Femmes en sciences : portraits de femmes en astronomie
À l’occasion de la journée internationale des femmes et des filles de science proclamée le 11 février par l’Assemblée générale des Nations Unies et dans le cadre de l’alliance européenne European Space University for Earth and Humanity (UNIVERSEH) axée sur la thématique de l’espace, découvrez le témoignage de quatre femmes scientifiques de l’UNamur qui travaillent sur des thématiques d’astronomie.
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Une nouvelle unité d'enseignement à l'UNamur : « One Health »
Dans un monde en perpétuel changement, où les crises sanitaires, environnementales et sociétales s'entrelacent, il devient impératif de repenser la santé dans une approche globale et interconnectée. C'est dans ce contexte que la Faculté de médecine de l'Université de Namur a inauguré sa nouvelle unité d'enseignement (UE) « One Health » ce jeudi 06 février 2025, en présence du Ministre Yves Coppieters. Cette initiative, proposée à tous les bacheliers de l’UNamur, ambitionne de former les professionnels de la santé de demain à une vision systémique, où la santé humaine, animale et environnementale sont envisagées comme une seule et même réalité.
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Charlotte Beaudart, Namuroise de l’année : une récompense pour ses recherches sur le vieillissement
Nous aider à vieillir en bonne santé et de manière autonome. Tel est l’objectif que mène Charlotte Beaudart, à travers sa recherche consacrée à la sarcopénie, une maladie liée au vieillissement qui peut survenir dès l’âge de 50 ans. Le travail de la chercheuse de l’UNamur membre de l’Institut Narilis est une nouvelle fois récompensé, puisqu’elle vient d’obtenir le titre de « Namuroise de l’année », pour la catégorie Sciences !
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ALTAïS – Pénétrer dans les profondeurs de la matière pour répondre aux enjeux actuels
Fondé il y a une cinquantaine d’années, le Laboratoire d'Analyse par Réactions Nucléaires (LARN) du Département de physique de l’Université de Namur abrite un accélérateur de particules tandem 2MV nommé ALTAÏS (Accélérateur Linéaire Tandetron pour l’Analyse et l’Implantation des Solides), en service depuis 1999.
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Thomas Balligand : de la médecine à la recherche fondamentale
Thomas Balligand, désormais chargé de cours à l'UNamur, allie sa passion pour la recherche fondamentale et l'enseignement en histologie et cytologie. Après un parcours diversifié en médecine interne et en recherche, notamment à Harvard, il se consacre à la formation de la prochaine génération de scientifiques tout en poursuivant ses travaux sur les nanobodies et leur potentiel en immunothérapie. Sa volonté d'éveiller la curiosité scientifique chez ses étudiants illumine son nouveau rôle au sein de l'université.
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Appels FNRS 2024 : Focus sur l’Institut naXys
Le professeur Elio Tuci vient d'obtenir un financement Crédit de Recherche du FNRS. L'institut naXys s'est spécialisé dans l'analyse des systèmes complexes, qu'il s'agisse d'astronomie et de cosmologie dynamique, de biologie mathématique, d'optimisation en optique, de complexité économique ou encore de l'étude de la stabilité et de la robustesse de ces systèmes. L’institut est structuré en 6 axes de recherche : Space, Bio, Optics, Eco, Robust et Robotics.
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Des contraceptifs oraux plus sûrs grâce aux œstrogènes naturels
Une avancée majeure pour la santé des femmes sous contraceptif oral a été réalisée par des chercheurs namurois. Chaque année, en Europe, plus de 22 000 cas de thrombose veineuse ou d’embolie sont dénombrés chez les utilisatrices de pilule contraceptive. Une équipe de chercheurs de l’Université de Namur, en collaboration avec QUALIblood (spin-off), a mené une étude importante dont les résultats pourraient transformer les recommandations en matière de prescription.
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