Au terme du cours, l'étudiant(e) sera familiarisé avec le monde bactérien, tant du point de vue de la structure cellulaire et du métabolisme des bactéries que du point de vue des rôles joués par les bactéries dans les divers écosystèmes qu'elles ont colonisé. Un aperçu des pathologies bactériennes et des traitements possibles sera aussi acquis par l'étudiant(e).
Le cours de Bactériologie va s’appuyer sur le rôle des bactéries dans les processus évoqués dans d’autres cours, comme la digestion, le métabolisme et le recyclage des matières. L'étudiant(e) connaitra la structure générale des bactéries et de leurs appendices, les principes de base des métabolismes bactériens, l'établissement des communautés bactériennes et la génération de pathologies bacteriennes.
Les transferts horizontaux de gènes et la génétique bactérienne sont évoquées dans d’autres cours, Génétique (Bloc 2 Biologie) et Compléments de génétique (Bloc 3 Biologie).
Le cours sera divisé en quatre parties, illustrées des démonstrations intégrées au cours tels que la mise en culture et l’observation de bactéries au microscope.
- Structure et fonctions des cellules bactériennes
- Métabolismes bactériens et recyclage des matières
- Communautés bactériennes : biofilms et microbiotes
- Introduction à la pathogénie bactérienne
Introduction générale
Les cellules bactériennes : structures et fonctions
- structure générale
- enveloppes
- cytoplasme
- appendices
- cycles cellulaires
Métabolismes bactériens et recyclage des matières
- catégories nutritionnelles
- synthèse des précurseurs
- production d’énergie et de puissance réductrice
- biosynthèse des polymères
Communautés bactériennes
- biofilms
- microbiomes
- phages
Pathogènes bactériens
- définitions
- survie intra- et extra-cellulaire
- toxines
- les antiseptiques et les désinfectants
- les antibiotiques
- résistance aux antibiotiques et persistance
Des démonstrations seront réalisées au cours afin d'illustrer des points importants de la matière.
Le cours se donnera en auditoire et sera émaillé de démonstrations pratiques des principes clés vus en théorie.
L'évaluation prendra la forme d'un examen oral, dont le but sera d'évaluer les connaissances de base de l'étudiant(e) sur les différents aspects de la bactériologie qui auront été vus au couyrs, y compris les démonstrations. L'étudiant, après avoir pris connaissance de ses questions, disposera d'un temps de préparation (environ 30 minutes) et sera ensuite amené à présenter sa réponse, accompagnée de schémas clairs et précis.
Une copie des dias en PDDF sera disponible au fur et à mesure de la progression du cours.
L'ouvrage de référence est "Biologie des micro-organismes" (Brock), Ed. Pearson. Disponible à la BUMP (en anglais).